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美國國家航天航空局(NASA)計劃在宇宙空間站進行測序實驗
發布時間:2016-11-23 11:19:49
7月18日,美國國家航天航空局(NASA)將往國際空間站(ISS)運送下一批物資及科研設備,其中括含牛津大學的MinIon納米孔測序設備??臻g站的宇航員將利用其對細菌,病毒及小鼠的DNA進行測序,并將這些數據將傳送回來,與地球上測得的結果進行比對。
MinIon納米孔測序儀
約翰遜航天中心的微生物學家Sarah Wallace認為,目前來說,MinIon是唯一一個可以放心在宇宙空間使用的測序儀。她告訴記者,儀器的大小是它的優勢之一,而且和Illumina以及Sanger法測序儀器不同的是,MinIon對于震動不敏感,另外耗電量也較小。
雖然,人們想對更多的微生物進行測序,但是MinIon在微重力的環境下工作的可靠性還需要進行確認。其中一個擔憂是樣品放入機器時會產生氣泡,雖然這在地球上并不是什么大問題。放置樣本的這一過程設計需要考慮到與航空工作環境相兼容。NASA還希望該系統可以滿足在ISS上分析測序數據的需求。
Wallace希望MinIon在ISS的研究可以為地球上的研究者所用。ISS作為一個國際性的實驗室, 如果這項研究可以進行, 那么該研究成果可以與整個學術界共享。
MinIon測序儀的其它應用
MinIon測序儀還有其他應用,Wallace的同事Aaron Burton一直在嘗試著使用MinIon來探測其它星球。因為它與其它測序儀完全不同的工作機制,它可以主動尋找DNA,RNA和蛋白質,如果對納米孔進行修飾,也許可以通過它來尋找不同種類的核酸。
Burton 說:“在我所了解的技術中,這是唯一一個可以用來尋找未知的儀器,我可以利用它找出一個樣本中所有的細菌,而不像PCR,我需要知道特異性的引物,然后去尋找已知的序列。這項技術剛好滿足了我們尋找未知序列的要求?!?/span>
NASA工作計劃
NASA計劃于7月18日將MinIon運往NASA極端環境任務操作間(NEEMO),這是一個水下工作站,位于弗羅里達Key Largo海岸線上。在這個模擬的宇宙工作站中,研究者和工程師也會進行同樣的測序實驗。其余科學家已經為在宇宙空間站的實驗做好準備,確保儀器在空間站的工作與在地球一樣。
Bruce Hammer是明尼蘇達州中心大學磁共振研究所的教授,他曾建議開展針微重力環境下骨小體的組學研究。在NASA的電話會議上Hammer教授說,他們將會對7月18日運送到ISS的骨小體樣本進行基因表達,蛋白表達,兩種表達之間的關系以及骨小體新城代謝水平的研究。這項研究預計將于九十月份開始,宇航員會先解凍這些細胞。一旦該實驗開始,他和他的同事將會對在ISS上得到的數據與地球上模擬微重力環境下得到的數據進行對比。